Kysymys:
Kuinka yhdistää Avogadron rakenteet tietyissä kulmissa?
Ro Siv
2017-03-04 00:44:11 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Työskentelen tämän hiilinanorakenteen kanssa Avogadrossa, ja kahden nanorakenteeni välinen risteys, johon yritän liittyä, ei koskaan näytä olevan hyvin linjassa. Se näyttää aina olevan pois kilteristä, mikä johtuu todennäköisesti siitä, kuinka siirrän risteyksen asentoon (manuaalinen vetäminen).

enter image description here

Lähetin kuvan ongelmastani yllä. Missä kaksi valkoista nuolta ovat, se häiritsee minua. Haluaisin, että ne ovat mahdollisimman pystysuoria, mutta en tiedä tapoja tehdä tämä lukuun ottamatta atomien / sidosten manuaalista säätämistä, mikä ei mielestäni saisi niitä tasaamaan tarkasti.

UPDATE:

Khaverimin neuvojen mukaisesti noudoin hänen ensimmäisiä ohjeita, käyttäen MMFF94: ää UFF: n sijaan (unohdin muuttaa sitä ja rakenne on suuri, joten optimointi vie jonkin aikaa, yrittää myöhemmin UFF: n kanssa), ja sai seuraavan rakenteen:

enter image description here

Olen melko varma, että he kaikki ovat tasaisesti kulmassa, ainakin näyttää olevan niin, joten kiitos.

Jos et välitä, jaa linkki järjestelmän .xyz-tiedostoon.
Pelkään, että en usko, että tämä on lainkaan mahdollista Avogardon kanssa. Minulla ei henkilökohtaisesti ole juurikaan kokemusta itse ohjelmasta, koska minusta on erityisen ikävä rakentaa molekyyli, jolla on symmetrisiä piirteitä. Sikäli kuin tiedän, sillä on vain vedä ja pudota -työkaluja geometrian manipuloimiseksi. Jos avaat kysymyksesi ehdottaa vaihtoehtoisia ohjelmia, saat todennäköisesti toimivan ratkaisun. Luulisin, että se olisi melko helppoa [ChemCraft] -palvelun (http://www.chemcraftprog.com/) kanssa, mikä ei valitettavasti ole ilmainen.
Minulla ei ole pääsyä siihen juuri nyt, mutta Turbomolen rakennustyökalu (mukana TmoleX: ssä) on ilmainen akateemiselle tai henkilökohtaiselle käytölle ja alustojenväliselle. Pyrin lähettämään kuvan sen soveltamisesta myöhemmin, koska ainoa käytettävissä oleva vastaus turvautuu ulkopuolisiin ohjelmiin.
@Martin- マ ー チ ン Kuinka voin muokata palkkion vastauksesi mahdollistamiseksi. Salliiko ChemCraftin kokeiluversio myös minun tehdä tämän?
@khaverim Minun on kysyttävä neuvonantajalta lupaa linkittää .xyz-tiedosto valitettavasti.
@Martin- マ ー チ ン Avogadrolla on (erittäin nopeita) geometrian optimointialgoritmeja, kuten vastaukseni ensimmäisessä osassa mainitaan. Symmetristen molekyylien valmistaminen on paljon helpompaa kuin olet ehkä kuvitellut. (Lisäsin vastaukseen vastauksen) Lisäksi - ChemCraft on ilmainen tällä hetkellä 150 ensimmäisen päivän ajan. Juuri asentanut sen viime viikolla, vaikka en ole perehtynyt sen käyttöön.
Et voi muokata palkkaviestiä suoraan, mutta voit muuttaa kysymystä ja muokata otsikkoa. Voit esimerkiksi lisätä lauseen, jossa pyydät vaihtoehtoja, jos Avogadro ei pysty siihen. Koska nykyinen vastaus jo tekee sen, en näe mitään ongelmaa.
Voitko asettaa palkkion, joka on suurempi kuin maineesi ??? !!!
@AaronJohnSabu Tuolloin, kun asetin palkkion, se vähensi 150 mainetta minusta.
@khaverim Anteeksi, jos tämä oikeuttaa toisen kysymyksen, mutta kuinka voin selvittää, onko lopullinen rakenteeni, jonka saan post-optimoinnista, todella symmetrinen, kuten puhuit Martinin kanssa yllä olevissa kommenteissa.
@RoSiv on todennäköisesti hyvä erillinen kysymys tässä vaiheessa, mutta haluaisin 1) varmistaa, että järjestelmä on keskitetty noin 0,0,0: een (esim. Jokin ohjelma. Luulen, että Avogadro tekee sen automaattisesti, kun tallennat .xyz: n, mutta kirjoitin kuoren komentosarja myös sille: https://github.com/khavernathy/useful_computational_chem/blob/master/center_it.sh); 2) tarkista, ovatko halutut atomit samantasoisia (niillä on sama suorakulmainen koordinaatti halutulle ulottuvuudelle). ts. en usko, että matematiikan tekemisen lisäksi on helppo tapa.
Kaksi vastused:
khaverim
2017-03-06 09:28:41 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Yrititkö (Universal Force-Field) geometrian optimointia ? Haluan:

  1. Valitse kaikki atomit
  2. Poista 4 (6? 8?) Kiinnostavan hiilen valinta (pidä Ctrl + napsautus painettuna)
  3. Valitse Laajennukset -> Molekyylimekaniikka -> Ohita valinta
  4. Napsauta Laajennukset -> Optimoi geometria

Vaihtoehtoisesti voit optimoida vielä muutaman atomin sillan ympärillä / sillassa, kun taas muut ovat rajoitettu. G.O.-algoritmi on melko vankka ja käsittelee monia järjestelmiä melko hyvin. Yksinkertainen esimerkki käsin piirretystä sykloheksaanista: enter image description here

Sain tällaisen tuloksen tekemällä tekemällä 2 nanoputkea kiraalisella indeksillä (4,4 ), piirtämällä 6 joukkovelkakirjaa ja optimoimalla silta: enter image description here

Jos tämä ei ole tehokasta, turvautun seuraaviin:

  1. Muuta 4 hiiltä eri elementeiksi, esim.

$ \ ce {OH} $

$ \ ce {NS} $

(kuten kuvassa oleva järjestely, jotta voit tunnistaa ne myöhemmin)

  1. Napsauta File -> Save As ... ja tallenna tiedosto .xyz

  2. Laske ON- ja HS-etäisyys arvolla $ r_ {ij} = \ sqrt {\ Delta x ^ 2 + \ Delta y ^ 2 + \ Delta z ^ 2} $ koordinaateista .xyz tiedosto.

  3. Ihannetapauksessa Avogadro tallensi .xyz-koordinaatit tasattuna z: ään (mikä on oletusarvo, kun piirrät molekyylejä kääntämättä aloitusnäkymää).

  4. (Vaikka ei, niin) kirjoita x : iin ja z: een kohdistettujen atomien koordinaatit uudelleen, esim. $ \ ce {O} $ paikassa $ (x, y, z) $; $ \ ce {N} $ hintaan $ (x, yr, z) $.

  5. Tai (yikes) kirjoita pikaohjelma luodaksesi mahdolliset järjestelmät kiinteällä $ r $: lla laskit, nimeä heille system-000.xyz , system-001.xyz , system-002.xyz jne. ja tarkastele "liikerata" kehystää, kunnes löydät yhden miellyttävän. (Katselua voidaan helpottaa huomattavasti VMD: llä, esim. vmd system - *. Xyz ).

Avogadron välttäminen: Jos käytät Molden -sovellusta ja lataat järjestelmääsi (kuten .xyz, .car, .pdb jne.), voit käyttää ZMAT-editoria sidontakulmien ja -dihdereiden manuaaliseen muuttamiseen. :

enter image description here

Jos kaikki muu epäonnistuu, voi olla aika harkita järjestelmän täydellistä kvanttimekaanista käsittelyä (jos olet perehtynyt korkean suorituskyvyn tietojenkäsittelyyn) ilmaisella (korkeakouluille!) -ohjelmalla, kuten Orca (jossa voidaan rajoittaa tiettyjä atomeja optimoinnin aikana). Esimerkki syötteestä olisi: 

 ! hf 6-31g * opt # tai copt, suorakulmaiseen optimointiin% palnprocs 128 # num. prosessorilähde% scfmaxiter 2000 # max itsekestävä kenttä iterointiend% geomConstraints # atomia pysymään kiinteinä alkaen indeksistä 0 {C 61 C} {C 62 C} {C 290 C} {C 291 C} {C 292 C} loppu * xyz 0 1 # lataus = 0; mult = 2S + 1 = 1 (suljettu kuori) C -1,306743 4,170005 1,012072 C -0,042414 3,718873 0,686759 C 0,210647 2,367809 0,785537 C -2,267754 3,21952 1,435683 C -2,920909 0,889649 1,948837 C -4,1532718,1151877,18313,18713,18713,18713,18713,18713,18713,18713,18713,187,137,18713,18713,18713,187,13 2.735382 C -3.332221 -1.380404 2.172864 ....... jne. *
Vaikka pidän Moldenista paljon, sillä on usein vaikeuksia löytää hyvä z-matriisi manipuloitavaksi monimutkaisissa järjestelmissä. Yhden kulman muuttaminen voi helposti pilata koko molekyylin riippuen siitä, miten suhteelliset yhteydet määritellään. Olen kuitenkin tavallaan samaa mieltä siitä, että tämä tehtävä vaatii erilaista ohjelmaa kuin Avogadro.
@Martin- マ ー チ ン Tai "yksinkertaiset" järjestelmät, joilla on korkea symmetria.
@LordStryker todellakin. Toistaiseksi tiedän vain, että ChemCraft käsittelee symmetriaa hyvin.
@khaverim Viimeisimmässä kuvassasi olet tehnyt sillan, vaikka halusin viisikulmioiden muodostavan vain sillan, ja näyttää siltä, ​​että sinulla on neliöitä, mitkä molekyylit valitsit ennen sillan optimointia? Vain ne, jotka ovat sillan sisällä? Ja sitten ohittitko loput valinnoista ennen optimointia? Miksi sivuuttaa miksi käyttää UFF: ää muiden optimointien sijaan? Kiitos.
@RoSiv selventää: haluatko 5 sidosta yhdistävän kaksi putkea? Näyttää siltä, ​​että kuvassasi on parillinen luku, kuten 4 ehkä. Tein vastauksen ensimmäisessä osassa esitetyn menettelyn: valitse kaikki, poista sidosatomien valinta (mikä on esimerkissäni 6), ohittaa valinta, optimoida. Sanon UFF, koska joskus se on välttämätöntä, jos sinulla on suuri järjestelmä. Muuten Avogadro oletusarvoisesti parantaa voimakenttää. (Ohjelma antaa sinulle yleensä vaihtoehdon, jos järjestelmä on liian suuri käsittelemään muiden kuin UFF-laitteiden kanssa)
Martin - マーチン
2017-03-07 14:09:34 UTC
view on stackexchange narkive permalink

En tiedä, voitko tehdä sen Avogadron kanssa, koska minulla ei ole laajempaa kokemusta ohjelmasta. Sikäli kuin näen, sidoksen pituuksia / kulmia / kaksisuuntaisia ​​kulmia ei ole mahdollista muokata suoraan. Se tarjoaa suorakulmaisen koordinaattieditorin, mutta rakenteen käsittely on yhtä tylsiä kuin käsin tekemällä.

Oletan, että ongelmasi on melko helppo ratkaista ChemCraftilla. Tämä ohjelma tarjoaa työkalun yhdistää ja kohdistaa kaksi rakennetta kahdesta eri ikkunasta. Näin voit helposti yhdistää ennalta lasketut fragmentit menettämättä symmetriaa ja tekemättä mitään laskelmia käsin.

Koska minulla ei ole pääsyä mihinkään rakenteeseesi, aion opastaa sinut läpi esimerkin . Kupin $ \ ce {C70} $ nanoputkiosan $ \ ce {C40} $ buckminster fullerene, kahdesti. Molemmissa fragmenteissa on (ainakin) $ C_5 $ symmetria, mutta tämä ei ole välttämätöntä. Loppujen lopuksi tuotamme Fullerenen, jonka symmetria on $ D_ \ mathrm {5h} $ . Tämän viestin sijoittamisen syistä sisällytän koordinaatit loppuun. (Käytän tällä hetkellä koontiversiota 485, mutta päivitettyjen versioiden pitäisi silti pystyä suorittamaan tämä.)

Aloitat avaamalla kaksi ChemCraft-esiintymää ja lataamalla kunkin fragmentin yhteen. Haluat, että osat kohdistetaan toisiaan kohti. Asettelussa muokkaan $ \ ce {C70} $ fragmenttia vasemmalla, kun taas oikeanpuoleinen ikkuna antaa minulle käyttämäni fragmentit (ei niin tässä yhteydessä). Kun tämä on tehty, valitset kohdistettavat atomit kussakin ikkunassa. Mitä enemmän atomeja valitset, sitä enemmän syötteitä ohjelmalle rakenteiden kohdistamiseksi. Näytön tulisi näyttää jonkin verran alla olevalta:

step 1

Valitse vasemmasta ikkunasta "Työkalut > Structure combiner > Yhdistä kaksi rakennetta kahdesta Chemcraft-ikkunasta valituilla alayksiköillä". Suuren symmetrian takia algoritmi saattaa saada väärän suunnan. Sitten on parasta yrittää valita (yksi tai kaksi) vähemmän atomia.

step2

Oikean ikkunan pitäisi nyt näyttää alla olevalta. On selvää, että atomit, jotka olet ottanut tasaamaan, ovat kaksinkertaiset sekoituksessa. Joissakin rakenteissa voit helposti valita ne ja poistaa ne, kun ne ovat liian hyvin yhteensopivia, voit vaihtaa näyttöjen välillä.

step3

Jos päätät "näyttää poistetut atomit", ne näytetään nukkeina; Kun napsautat Käytä, ne katoavat ja ohjelma sitoutuu molekyyliisi uudelleen.
Nyt toinen puoli on onnistuneesti rajattu, ja jatkan toisen kupin lisäämistä. Olemme luoneet mukavan pienen nano-pillerin. Valikosta voit valita symmetroida molekyyliä. Ihannetapauksessa tässä tapauksessa sen pitäisi olla jo hyvin, hyvin lähellä $ D_ \ mathrm {5h} $ . Karteesinen tila tuo tietysti esiin joitain esineitä. Kirjoita "Edit > Set point group ... > Auto", jotta ohjelma voi määrittää sen sinulle.

step4

Todellakin on pieni vaihtelu pisteryhmälle. Onneksi ohjelma voi myös korjata sen.

step5

Sinun ei tarvitse pysähtyä siihen. ChameCraftissa on xyz / distance / angle / dihedral -editori ikkunan vasemmassa alakulmassa riippuen valitsemiesi atomien määrästä. Voit valita, haluatko keskittää rakenteen vai siirtää vain viimeksi valitun atomin. Jos atomit eivät ole yhteydessä näkyviin sidoksiin, se manipuloi koko fragmenttia vastaavasti. Tämän ominaisuuden avulla voit hienosäätää kaiken, mutta sitten saatat tarvita kynää, paperia ja laskinta uudelleen.

move

Koska en tiedä tutkimuksen kontekstia, riittää, että sanotaan, että nämä ovat tekniikoita sopivan syöttögeometrian luomiseksi edistyneemmille laskentaohjelmille, joita on melko vähän. Hyvin suunniteltu geometria saattaa viedä kriittisen optimointiajan käsistäsi. En ole varma, kuinka hyvin voimakenttämenetelmät ovat nanoputkille, ja vaikka Avogadro tarjoaa metodologiaa yksinkertaisille orgaanisille molekyyleille, tällaiset projektit saattavat olla liian monimutkaisia, jotta se olisi järkevää. Sikäli kuin tiedän, Avogadrolla ei ole symmetriatunnistusta.

Liite

$ \ ce {C70} $ fragmentti : C -2,951975027 +1,706218740 -5.540304632C -3,391088176 +0,354767430 -5.540304632C -2,534920901 -2,280244499 -5.540304632C -1,385307752 -3,115487343 -5.540304632C -0,710500000 -3,334745672 -4.309125825C +0,710500000 -3,334745672 -4.309125825C +1,385307752 -3,115487343 -3.077947018C +2,534920901 -2,280244499 - 3.077947018C 2.951975027 -1.706218740 -4.309125825C +3,391088177 -0,354767430 -4.309125825C +3,391088177 +0,354767430 -3.077947018C +2,951975027 +1,706218740 -3.077947018C +2,534920901 +2,280244499 -4.309125825C +1,385307752 +3,115487343 -4.309125825C +0,710500000 +3,334745672 -3.077947018C -0,710500000 +3,334745672 -3.077947018C -1,385307752 +3,115487343 -4.309125825C -2,534920901 +2,280244499 - 4.309125825 C -2,951975027 +1,706218740 -3.077947018C -3,391088176 +0,354767430 -3.077947018C -3,391088176 -0,354767430 -4.309125825C -2,951975027 -1,706218740 -4.309125825C -2,534920901 -2,280244499 -3.077947018C -1,385307752 -3,115487343 -3.077947018C -0,710500000 -3,334745672 -1.846768211C +0,710500000 - +3,334745672 -1.846768211C +1,385307752 -3,115487343 -0.615589404C +2,534920901 -2,280244499 -0.615589404C +2,951975027 -1,706218740 -1.846768211C +3,391088176 -0,354767430 -1.846768211C +3,391088176 +0,354767430 -0.615589404C +2,951975027 +1,706218740 -0.615589404C +2,534920901 +2,280244499 -1.846768211C +1,385307752 +3,115487343 -1.846768211C +0,710500000 +3,334745672 -0.615589404C -0.710500000 3.334745672 -0.615589404C -1.385307752 3. 115487343 -1.846768211C -2,534920901 +2,280244499 -1.846768211C -2,951975027 +1,706218740 -0.615589404C -3,391088176 +0,354767430 -0.615589404C -3,391088176 -0,354767430 -1.846768211C -2,951975027 -1,706218740 -1.846768211C -2,534920901 -2,280244499 -0.615589404C -1,385307752 -3,115487343 -0.615589404C -0,710500000 -3,334745672 0.615589404C +0,710500000 -3,334745672 0.615589404C +1,385307752 -3,115487343 1.846768211C +2,534920901 -2,280244499 1.846768211C +2,951975027 -1,706218740 0.615589404C +3,391088176 -0,354767430 0.615589404C 3,391088176 0,354767430 1.846768211C 2,951975027 1,706218740 1.846768211C 2,534920901 2,280244499 0.615589404C 1,385307752 3,115487343 0.615589404C 0,710500000 3,334745672 1,846768211 C -0,710500000 +3,334745672 1.846768211C -1,385307752 +3,115487343 0.615589404C -2,534920901 +2,280244499 0.615589404C -2,951975027 +1,706218740 1.846768211C -3,391088176 +0,354767430 1.846768211C -3,391088176 -0,354767430 0.615589404C -2,951975027 -1,706218740 0.615589404C -2,534920901 -2,280244499 1.846768211C -1,385307752 -3,115487343 +1,846768211

$ \ ce {C40} $ -fragmentilla on seuraavat koordinaatit: 

 40symmetry c1C -0.004840185 -3.437248260 -1.231937277C -1,267748660 -3000481413 -1,692390182C -2,250219438 -2,561103110 -0,763208689C -3,030739803 -1,417632648 -1,047784233C -2,833456162 -0,706703611 -2,263242764C -2,833456162 0,33670 19438 +2,561103110 -0.763208689C -1,267748660 +3,000481413 -1.692390182C -0,004840185 +3,437248260 -1.231937277C +0,283148522 +3,437248269 0.160450194C +1,546056995 +3,000481414 0.620903095C +2,528527766 +2,561103104 -0.308278399C +3,309048125 +1,417632641 -0.023702855C +3,111764498 +0,706703610 1.191755677C +3,111764498 -0,706703610 1.191755677C +3,309048125 -1,417632641 -0.023702855C +2,528527766 -2,561103104 -0.308278399C +1,546056995 -3,000481414 0.620903095C +0,283148522 -3,437248269 0.160450194C -0,693482914 -3,000481414 1.084109073C -1,963942392 -2,561103104 0.620903094C -2,567533811 -1,417632641 1.191755675C -3,226850870 -0,710929034 0.160450192C -3,226850870 +0,710929034 +0,160450192
C -2,567533811 +1,417632641 1.191755675C -1,963942392 +2,561103104 0.620903094C -0,693482914 +3,000481414 1.084109073C -0,034165862 +2,293777797 2.115414553C 1,349945920 2,293777797 1.829137515C 2,135133060 1,143470461 2.115414554C 1,531541637 0,000000000 2.686267134C +2,135133060 -1,143470461 2.115414554C +1,349945920 -2,293777797 1.829137515C -0,034165862 -2,293777797 2.115414553C - 0,641366192 -1,143470461 2,689680299C -1,904274667 -0,706703610 2,229227401C -1,904274667 0,706703610 2,229227401C -0,641366192 1.143470461 2,689680299C 0,1339154169 0,000000  nanopilleri:  
 130 symmetria d5hC 3.334745673 -0.710500000 -2.462357615C 3.334745673 0.710500000 -2.462357615C +3,115487344 +1,385307752 -1.231178807C +2,280244500 +2,534920901 -1.231178807C +1,706218741 +2,951975027 -2.462357615C +0,354767431 +3,391088176 -2.462357615C -0,354767429 +3,391088176 -1.231178807C -1,706218739 +2,951975027 -1.231178807C -2,280244498 +2,534920901 -2.462357615C -3,115487342 +1,385307752 -2.462357615C -3,334745671 +0,710500000 -1.231178807C -3,334745671 -0,710500000 -1.231178807C -3,115487342 -1,385307752 -2.462357615C -2,280244498 -2,534920901 -2.462357615C -1,706218739 -2,951975027 -1.231178807C -0,354767429 -3,391088176 -1.231178807C +0,354767431 -3,391088176 -2.462357615C +1,706218741 -2,951975027 -2.462357615C 2,280244500 -2,534920901 -1,231178807C 3,115487344 -1,385307752 -1,231178807
C +3,334745673 -0,710500000 0.000000000C 3,334745673 0,710500000 0.000000000C 3,115487344 1,385307752 1.231178807C 2,280244500 2,534920901 1.231178807C 1,706218741 2,951975027 0.000000000C 0,354767431 3,391088176 0.000000000C -0,354767429 +3,391088176 1.231178807C -1,706218739 +2,951975027 1.231178807C -2,280244498 +2,534920901 0.000000000C -3,115487342 +1,385307752 0.000000000C -3,334745671 0,710500000 1,231178807 C -3,334745671 -0,710500000 1.231178807C -3,115487342 -1,385307752 0.000000000C -2,280244498 -2,534920901 0.000000000C -1,706218739 -2,951975027 1.231178807C -0,354767429 -3,391088176 1.231178807C +0,354767431 -3,391088176 0.000000000C +1,706218741 -2,951975027 0.000000000C +2,280244500 -2. 534920901 1.231178807C +3,115487344 -1,385307752 1.231178807C +3,334745673 -0,710500000 2.462357615C +3,334745673 +0,710500000 2.462357615C +1,706218741 +2,951975027 2.462357615C +0,354767431 +3,391088176 2.462357615C -2,280244498 +2,534920901 2.462357615C -3,115487342 +1,385307752 2.462357615C -3,115487342 -1,385307752 2.462357615C -2,280244498 -2,534920901 2.462357615C +0,354767431 -3,391088176 2.462357615C +1,706218741 -2,951975027 2.462357615C -1,717973404 +3,000456514 3.693536421C -0,373754410 +3,437219745 3.693536421C +0,373754411 +3,437219749 4.903041136C +1,717973407 +3,000456525 4.903041139C +2,322720745 +2,561081857 3.693536424C +3,153493774 +1,417620883 3.693536424C +3,384486708 +0,706697748 +4,903041140
C +3,384486708 -0,706697748 4.903041140C +3,153493774 -1,417620883 3.693536424C +2,322720745 -2,561081857 3.693536424C +1,717973407 -3,000456525 4.903041139C +0,373754411 -3,437219749 4.903041136C -0,373754410 -3,437219745 3.693536421C -1,717973404 -3,000456514 3.693536421C -2,322720749 -2,561081859 4.903041134C -3,153493775 -1,417620884 4.903041132C -3,384486697 -0,706697747 3.693536419C -3,384486697 +0,706697747 3.693536419C -3,153493775 +1,417620884 4.903041132C -2,322720749 +2,561081859 4.903041134C -1,579654762 +2,561081856 6.105357127C -0,227398602 +3,000456514 6.105357127C +0,745287399 +2,293758766 6.848429277C +1,947593421 +2,293758772 6.105357132C +2,783333689 +1,143460975 6.105357132C +2,411800691 0. 000000000 6.848429279C +2,783333689 -1,143460975 6.105357132C +1,947593421 -2,293758772 6.105357132C +0,745287399 -2,293758766 6.848429277C -0,227398602 -3,000456514 6.105357127C -1,579654762 -2,561081857 6.105357127C -1,951187752 -1,417620880 6.848429274C -2,923873754 -0,710923134 6.105357124C -2,923873754 +0,710923134 6.105357124C -1,951187752 +1,417620880 6.848429274C -0,972686005 +0,706697746 7.595944297C +0,371532989 +1,143460974 7.595944302C +1,202306016 +0,000000000 7.595944306C +0,371532989 -1,143460974 7.595944302C -0,972686005 -0,706697746 7.595944297C -1,717973404 -3,000456514 -3.693536421C -0,373754410 -3,437219745 -3.693536421C +0,373754411 -3,437219749 -4.903041136C +1,717973407 -3,000456525 - 4.903041139
C +2,322720745 -2,561081857 -3.693536424C +3,153493774 -1,417620883 -3.693536424C +3,384486708 -0,706697748 -4.903041140C 3,384486708 0,706697748 -4.903041140C 3,153493774 1,417620883 -3.693536424C 2,322720745 2,561081857 -3.693536424C 1,717973407 3,000456525 -4.903041139C 0,373754411 3,437219749 -4.903041136C -0,373754410 +3,437219745 -3.693536421C -1,717973404 +3,000456514 -3.693536421C -2,322720749 +2,561081859 -4.903041134C -3,153493775 +1,417620884 -4.903041132C -3,384486697 +0,706697747 -3.693536419C -3,384486697 -0,706697747 -3.693536419C -3,153493775 -1,417620884 -4.903041132C -2,322720749 -2,561081859 -4.903041134C -1,579654762 -2,561081857 - 6,105357127C -0,227398602 -3 000456514 -6,105357127C 0,745287399 -2. 293758766 -6.848429277C +1,947593421 -2,293758772 -6.105357132C +2,783333689 -1,143460975 -6.105357132C +2,411800691 +0,000000000 -6.848429279C +2,783333689 +1,143460975 -6.105357132C +1,947593421 +2,293758772 -6.105357132C +0,745287399 +2,293758766 -6.848429277C -0,227398602 +3,000456514 -6.105357127C -1,579654762 +2,561081856 -6.105357127C -1,951187752 +1,417620880 -6.848429274C -2,923873754 +0,710923134 -6.105357124C -2,923873754 -0,710923134 -6.105357124C -1,951187752 -1,417620880 -6.848429274C -0,972686005 -0,706697746 -7.595944297C +0,371532989 -1,143460974 -7.595944302C +1,202306016 +0,000000000 -7.595944306C +0,371532989 +1,143460974 -7.595944302C -0,972686005 +0,706697746 -7,595944297
Tämä menetelmä toimi oikeastaan ​​paremmin kuin ensimmäinen vastaus, koska sain oudot kulmat yhdistyneen nanoputken yhdelle osalle vain käyttäessäni Avogadroa. Onko keino jakaa palkkio sinun ja Khaverimin välillä?
@RoSiv Ei, palkkion jakaminen ei ole mahdollista, mutta se on ok. Autan mielelläni enkä tarvitse enempää mainetta. Loppujen lopuksi kysymyksesi antoi minulle mukavan mahdollisuuden pelata leluillani: D


ⓘ
Tämä Q & A käännettiin automaattisesti englanniksi.Alkuperäinen sisältö on saatavilla stackexchange-palvelussa, jota kiitämme cc by-sa 3.0-lisenssistä, jolla sitä jaetaan.
Loading...